İnsanların DNA’larıyla oynayarak onları daha zeki hale getirmek isteyen bir grup bilim insanı, çalışmalarını öncelikle birtakım fare üzerinde dener ancak sadece tek bir fare üstün zekâlı olur: Clementine! Clementine, su kabından su içerken aynı zamanda matematik denklemleri çözen, rüyalarını Latince gören, düşündükçe etrafına ahududu kokusu yayan bir faredir

Deney hayvanlarının sonlarını bilen biri, bir gün Clementine’ı ve ona çok benzeyen Hamlet’i laboratuvardan kaçırarak onları kurtarmaya çalışır

Clementine’ın yolu böylelikle Gus ve Pop ile kesişmiş olur

Clementine özel bir fare olduğu için, kaçırılmasının haberi bütün ülkeye yayılır

Clementine’ı laboratuvara teslim edip onu kaderine terk etmek istemeyen Gus ve Pop, Clementine’ı insanlara tanıtmaya karar verirler

Plan basittir: Clementine’ı herkes çok sevecek ve onun; tüm deney hayvanlarının yaşaması için insanlar bilinçlendirilecek

Kendisi de bir satranç ustası olan Pop, Clementine’ı satranç şampiyonlarına karşı oynayıp hünerlerini sergilemesi için eğitmeye karar verir

Sevgiler, Clementine, dahî bir laboratuvar faresinin, çok sevdiği arkadaşı Rosie’ye mektuplar düşündüğü bir hikâye